Es un templo neo-gótico de principios del siglo veinte, consta de tres naves, con altares laterales, un presbiterio despejado con el camarín de la Virgen y retablo neo-gótico. Tiene un amplio coro y órgano que se utiliza en el culto habitualmente.
Es reflejo de una tradición musical muy presente en la vida franciscana y particularmente de esta comunidad. El sonido de las campanas del santuario acompaña a los vecinos y visitantes de Chipiona y forma parte de su vida cotidiana desde su construcción.